为确保一旦发生禽流感能及时报告疫情，日本政府决定，对有义务报告而没有及时报告者加大惩罚力度，因发生禽流感而导致鸡肉鸡蛋无法上市的疫情发生地周边地区将完善补偿措施。农林水产省还将对养鸡农家、鸡肉和鸡蛋销售商店、餐饮业给予金融政策支援等。为确保贯彻执行以上措施，政府决定制定家畜传染病预防法修正案，提交本届国会审议通过。
此外，为查明传染途径，环境省设置了专家小组，由环境省自然环境局长、防疫官员和鸟类专家等２２人组成，负责组织都道府县调查乌鸦、鸽子感染禽流感病毒情况。厚生劳动省负责实施防止发生人际间禽流感传染的相关对策，食品安全委员会和文部科学省等负责防止受禽流感病毒感染的鸡肉鸡蛋流入市场，以及把握流入市场后对国民健康造成的危害等。
