东山县是福建重点渔区，近年来已推广发展轻型、节能的流刺和笼捕钓捕等作业渔船200多艘，捕获品种以鱿鱼、鲨鱼、带鱼等高档鱼类为主，比其他鱼货价格上浮5%以上，增收达3500万元。
该县水产养殖己形成一定规模，他们十分注重科技工作，发挥“全国水产养殖示范基地”的作用，组织渔农民实施“精品工程”，先后引进日本、台湾和国内水产技术专家52名，并与国家海洋局第三海洋研究所等科研单位建立了技术协作关系，解决了深水、立体、潮间带、陆地工厂化养殖等多项技术难题，并在控光控温育苗、饵料配制、科学喂养、虾池混养和综合利用、新品种引进等方面取得了重大突破。积极抓好海区网箱养鱼以及鲍、对虾、鳗鱼、贝藻类等8万亩基地的品种改良，加强对全县500多家陆上工厂化养殖鲍、牙鲆鱼、鳗鱼等水产养殖场的技术指导，使养殖场水产品质量提高，收入增加。目前，全县黑色鲍工厂化和网箱养殖面积达7万多平方米，今年上半年销售成品黑色鲍200多吨，比去年同期增长1倍多，培育黑鲍苗4500万粒，两项合计增收1600万元。海上陆上养殖牙鲆鱼面积达3200亩，销售增收1400万元。此外，还养殖了点带石斑鱼、红石斑、东方螺、东方鱼屯等品种，也获得了好收成。
